سیصد سال پس از اینکه سیاره زمین در جنگی تحت عنوان «سقوط» یا «جنگ بزرگ»، که با مریخ داشت ویران شد، دکتر دایسون ایدو باقی مانده یک سایبورگ مؤنث، اما دارای مغز سالم انسان را در گورستان زایدات پیدا میکند. ایدو بدن جدیدی را به مغز پیوند میزند و نام او را به یاد دختر مرحومش «آلیتا» میگذارد ...